Ao contrário do que pode parecer, esta resposta não é muito complicada, e na verdade a "culpada" pelo crescimento é a movimentação das placas tectônicas.
As montanhas "crescem" de tamanho devido ao constante movimento das Placas Tectônicas, já que quando uma delas submerge sob a outra, esta irá "subir". As montanhas que “crescem” ficam justamente nestas áreas de encontro das placas.
A medição citada na pergunta é demonstrada em períodos longos (cada 100 anos ou mais) porque o "crescimento" anual é muito pequeno, praticamente imperceptível.
Desta forma, de tempos em tempos a altura das montanhas é revista. Atualmente, entretanto, o "crescimento” verificado tem sido "menor" devido ao derretimento da neve nos topos das montanhas, por conta do aquecimento global (a neve do topo do monte Kilimandjaro, por exemplo, quase acabou).